ある朝、士郎は通学途中に遠くのビルの上に懐かしい人影を見る。その時は気のせいかと思い、やり過ごした士郎だったが、その夜、新都の路地裏で、士郎は死んだはずの養父、衛宮切嗣と邂逅する。それは彼が、穏やかな日常から、殺伐とした戦場へ足を踏み入れた瞬間であった。