高2で交際を始めたシンジとレイ。そんな二人の進展は周囲が心配になる程にまったりしているが、本人達は幸せいっぱい。そして大学生、交際3年目の記念日。レイはアスカのアドバイスで、初めてのメイクをしてデートに臨む。その日の夜、二人は『初めての夜』を迎える……